O mal da altitude é um desconforto natural sofrido pelos visitantes que chegam a Cusco, uma geografia montanhosa onde o oxigênio tem baixa pressão. Para reduzir os seus sintomas (náuseas, dores de cabeça, fadiga), pode beber muita água, evitar bebidas alcoólicas e alimentos gordurosos. Em alguns dias, os sintomas irão embora por conta própria.

A Salkantay Trek é uma das rotas mais difíceis. É uma caminhada de 5 dias e 4 noites para Machu Picchu através de altas montanhas perto da montanha coberta de neve Salkantay, bem como paisagens tropicais que terminam na cidade inca de Machu Picchu.

A caminhada Huchuy Qosqo é uma das trilhas para caminhadas mais fáceis. Inclui uma caminhada de apenas 17 quilômetros que inclui uma visita ao sítio arqueológico de Huchuy Qosqo e termina na cidade inca de Machu Picchu. É uma rota ideal para fazer com crianças.

Embora não seja recomendado, é possível fazer alguns percursos pedestres sem um tour. Por exemplo, o visitante pode fazer o Salkantay Trek, o Lares Trek, o Huchuy Qosqo Trek por conta própria. A única rota de caminhada que não pode ser feita sem um tour é a Trilha Inca Clássica de 4 dias.